目前國內外公認的原發性肝癌分期標準是2002年修訂的國際抗癌聯盟（UICC）和美國腫瘤聯合會（AJCC）聯合制定的TNM分期法。
肝癌TNM分期是根據病情嚴重程度及發展階段進行的， TNM中T代表腫瘤， N代表荷瘤器官區域淋巴結， M代表遠處轉移， 而在這三個方向下再詳細地分成各個期別：
T1：表示腫瘤的直徑在2cm以下， 而且還沒有發生血液、淋巴轉移。
T2：表示腫瘤的直徑雖然不到2cm， 但腫瘤已侵犯了離它較近血管;或者是有兩個直徑不足2cm的癌症腫塊， 但沒有侵及血管;直徑2cm以上的腫瘤， 但沒有侵及血管也算此類。
T3：表示直徑2cm以上的腫瘤，
T4：是指兩葉肝臟都已有了腫瘤， 或是腫瘤已侵犯到肝臟的門靜脈。
N：N0表示沒有發生淋巴結的轉移， N1表示有轉移。
M：M0表示沒有發生遠端轉移， M1表示有遠端轉移。
TNM分期主要根據腫瘤的大小、數目、血管侵犯、淋巴結侵犯和有無轉移而分為Ⅰ， Ⅱ， Ⅲa， Ⅲb， Ⅲc， 和Ⅳ期， 由低到高反映了腫瘤的嚴重程度：
Ⅰ期：T1、N0、M0；
Ⅱ期：T2、N0、M0；
Ⅲa期：T3、N0、M0
Ⅲb期：T4、N0、M0
Ⅲc期：任何T、N1、M0；
Ⅳ期：任何T、任何N、M1。
