臨床上很多疾病可以自愈， 也有的疾病是需要治療才能痊癒的。 肌腱炎作為臨床上常見疾病自愈的可能性基本上沒有， 針對肌腱炎的問題一定要採取治療， 治療方案多樣， 可以選擇最適合的治療方法。
1.肌腱炎一般不能自愈， 要治療才行。 急性期應使用冰敷， 每數小時冰敷患區20分鐘；並且抬高並固定患肢；對於上肢的肌腱炎， 可以使用支具或石膏固定於合適的功能位置， 休息是緩解肌肉緊繃的最好方法；其他位置的肌腱炎， 可以用彈力繃帶包紮減輕水腫。 急性期過後， 制定適合的康復計畫， 提高肌肉的強度，
2.藥物治療。 可以使用非甾體抗炎藥物緩解疼痛。 嚴重的疼痛， 可以局部注射類固醇激素， 可以控制炎症、減輕疼痛。 然而不推薦反復多次注射類固醇， 因為多次注射類固醇可以減弱肌腱的強度， 導致肌腱斷裂。
3.手術治療。 部分患者、尤其是產生粘連時；若以上治療方式無效， 可考慮手術治療。 術縱行切開狹窄腱鞘， 切除一小條腱鞘， 從而根除疼痛來源。 缺點：創傷大， 痛苦大， 恢復期長。
4.理療。 洗按摩浴可幫助提高體溫並促進血液迴圈。 若肌腱炎發生在膝蓋部位， 可用溫濕的毛巾熱敷。 近年來有採用超聲波療法治療肌腱炎， 特別是伴有鈣化的肌腱炎的報導， 但其療效仍需要進一步證實。
