丙型肝炎的臨床症狀、體征和其他病毒性肝炎無顯著區別， 所以診斷丙型肝炎除了進行肝功能檢查以外， 主要依靠病毒學指標。
丙型肝炎病毒學指標包括抗-HCV及HCV-RNA， 現分述如下：
（1）抗-HCV。 即丙肝抗體， 不是中和抗體， 對人體無保護作用， 是目前診斷丙型肝炎的主要指標。 但因感染HCV後抗-HCV出現較慢， 一般在發病後2～6個月， 甚至1年才轉陽， 故不能作為早期診斷丙型肝炎的方法；而且一次檢查陰性， 也不能直接作否定診斷。 當各型病毒性肝炎特異性標誌檢測陰性， 臨床症狀及單項ALT升高提示急性病毒性肝炎時， 應考慮是否為丙型肝炎感染。
（2）HCV-RNA。 即丙型肝炎病毒的核糖核酸， 是HCV的遺傳物質， 是表示體內感染HCV的直接指標。 目前用PCR方法可以直接檢測血中的HCV-RNA， 可用於HCV感染的早期診斷， 因其較丙型肝炎抗體出現早， 故是丙型肝炎病原學診斷和判斷傳染性的一項有用的指標。
總之， 對有典型臨床表現且其發病與輸血及血製品密切相關， 已排除其他肝炎的可疑丙型肝炎患者， 可進一步查HCV-RNA及抗-HCV， 如HCV-RNA 及抗-HCV均陽性或HCV-RNA單獨陽性即可確診為丙型肝炎。
