受恙蟎幼蟲叮咬後局部可發生丘疹、潰瘍或焦痂。 病原體先在局部繁殖, 繼經淋巴系統進入血循環而產生立克次體血症。 病原體死亡後釋出的毒素是致病的主要因素, 可導致各臟器的炎性病變和一些變性病變, 以及臨床上的毒血症症狀。
全身淋巴結輕度腫大, 潰瘍或焦痂附近的淋巴結腫大較著, 中央可呈壞死。 內臟普遍充血, 脾腫大數倍, 肝輕度腫大並有局灶性壞死。 心有局灶性或彌漫性心肌炎, 可伴出血及小的變性病變。 肺充血, 伴有支氣管肺炎和胸腔積液。 腦有淋巴細胞性腦膜炎, 腦幹處可見小出血點。
“斑疹傷寒結節”也見於本病, 小血管周圍有單核細胞、漿細胞、淋巴細胞等浸潤, 但血管內膜的內皮細胞腫脹不如流行性斑疹傷寒顯著, 血栓形成也較少見。