腦脊液常規檢查：為確定診斷必須做腦脊液檢查， 腦脊液壓力正常或輕度增高。 腦脊液外觀無色和清亮。 細胞計數白細胞增高， 介於10～500/mm3， 腦脊液的白細胞計數罕有低於10/mm3或高於1000/mm3， 但流行性腮腺炎和淋巴細胞脈絡叢腦膜炎病毒性腦膜炎的腦脊液白細胞可高達1000/mm3。 增高的白細胞分類主要為淋巴細胞， 但一些病例早期， 也可表現為多形核白細胞突出， 遇此情況應於24～48小時後複查腦脊液。 若是病毒性腦膜炎， 此時腦脊液中白細胞明顯由多形核為主轉換為單核細胞為主， 但細胞總數、蛋白和糖不改變。 腦脊液蛋白輕度增高，
一般病毒性腦膜炎腦脊液的糖水平高於同時血糖水準的50%。 雖有時可見腦脊液的糖水平和血糖水準的比值為0.3-0.5， 但若二者的比值低於0.3時應考慮細菌或真菌感染。 但在腮腺炎病毒、淋巴細胞脈絡叢腦膜炎病毒、單純皰疹和腸道病毒所致的腦膜炎時， 其腦脊液糖水平可較低， 於但在連續複查時， 不會呈進行性下降。 所以， 單憑一次腦脊液檢查的結果有時不可能與細菌性腦膜炎鑒別開來。 當腦脊液中白細胞總數超過500/mm3， 其中95%為多形核白細胞， 同時蛋白含量超過200mg/dl， 且糖水平低於同時血糖的50%時， 病毒性腦膜炎的可能性不大。 若腦脊液中發現紅細胞應與單純皰疹病毒感染和蛛網膜下腔出血相鑒別。
