一般來說， 肝炎的愈後大多數是良好的， 患了急性肝炎可以順利恢復， 不會演變成肝硬化或肝癌， 不過確實有少數乙型肝炎病人長期不愈， 逐漸發展成為肝硬化， 最終極少數病例發展為肝癌。 根據研究發現， 肝硬化70%-80%是由慢性乙型肝炎發展來的。
國外有報導慢性乙肝表面抗原攜帶者發生肝癌的危險性比非攜帶者高200倍以上。 95%以上的原發性肝癌中病人是由慢性乙肝表面抗原攜帶者演變而來的。 為什麼少數患乙型肝炎的病人， 能夠出現原發性肝癌的不良轉變呢？其機理目前尚未完全弄清楚，
有的學者認為， 既然乙肝病毒是罪魁禍首， 那麼防止乙型肝炎將有利於減少肝癌的發生， 持不同意見的科學家則認為， 肝癌發生的因素非常複雜， 乙肝病毒只是始動原因。 因為許多人感染了乙肝病毒， 但畢竟發展成肝硬化， 原發性肝癌的人僅僅是少數。 乙防治療乙肝肝炎固然非常重要， 但是採取單一措施未必能解決問題， 應該通過綜合的措施乙防肝炎慢性化， 防止癌變的發生。 例如患了乙肝應盡可能早治療， 盡可能避免使用損害肝臟的藥物， 避免有害的物理因數刺激， X線和射性物質對肝臟的照射。
很多肝炎病人， 在經歷頭痛、發熱等類似感冒症狀持續幾天之後， 又出現應盡可能減少或及早治療各種感染，
另外， 肝癌的發生亦與機體的免疫力有關。 正常人體內的細胞經常發生突變， 可能形成癌細胞， 但人體的免疫系統有清楚這些細胞的能力， 因而人體不體質， 增強人體的免疫力， 也是防止肝癌發生的重要方面。 會發生癌症。 但人體免疫力減弱時， 就容易發生癌變。
