儘管“無痛人流”相對來說更快速、安全、無痛， 但也不是人人都適用， 更不能經常做， 尤其是未生育過的女性更要慎做“無痛人流”。
首先， 術中所用的麻醉藥對呼吸系統有短暫抑制作用， 必須在有極好的監測及搶救設施下才可施行。 該術並非簡單， 而是屬於一種高危手術， 有嚴格條件與程式， 有心臟病史、血壓不正常或對麻醉藥物過敏者應慎重採用此術。 全身麻醉需要專業的麻醉師掌控， 並根據患者個人情況及對麻醉劑的反應隨時調整劑量， 但很多醫院並未在人流室配備專業的麻醉師， 而是由實施人工流產手術的婦產科醫生或者護士來給予全身麻醉。
其次， 在麻醉過程中， 很少數人發生過敏等反應， 需要麻醉醫生的監護方可安全過關。 但很多醫院在門診實施人工流產手術， 很難做到麻醉醫生在場的嚴密監護。
再次， 在實施“無痛人流”前必須禁食禁飲至少6小時， 否則在手術或麻醉中會出現嘔吐現象， 嚴重的會產生誤吸危險。 但很多患者和醫生由於對此重視不夠， 並未嚴格遵循這一點。
目前人工流產手術仍然處於醫生的經驗操作， 手術中觀察不到器械對子宮的損傷程度。 在普通的人工流產手術中， 醫生可根據患者對手術的反應來判斷是否操作得當。 但在“無痛人流”時， 因為受術者痛覺、意識消失， 若技術不熟練或操作粗魯，
其實“無痛人流”只是減輕受術者的痛苦， 由它引發的併發症(諸如子宮穿孔、不完全流產、細菌感染等)幾率並不少於其他方式的人流。
