1、染色體檢查 常規的染色體檢查包括染色體數目、形狀， 觀察染色體有否單倍體、三倍體出現， 染色體有否畸變、易位、倒錯等情況。
有下列情況者應作染色體檢查：①有先天畸形的家庭成員；②有多次流產病史的婦女及其丈夫；③有唐氏綜合征的兒童、兄妹及父母；④有明顯智慧減退和體態異常的神經系統疾患病者。
2、生化酶檢測 許多遺傳性代謝病的診斷依賴於血清、皮膚成纖維細胞、白細胞中某些特殊酶的缺乏予以診斷。
3、細胞學檢查 某些遺傳病， 如Gaucher病的肝、脾或骨髓中發現Gaucher細胞。 Niemann-Pick病者的骨髓中可以發現“泡沫細胞”。
4、重組核酸技術 從已知遺傳病病者的屍體的腦組織或活體標本中分離出信使RNA（mRNA）， 通過反轉錄酶將遺傳信息轉給DNA， 即互補DNA（cDNA）上形成DNA探針。 然後， 應用核素標記cDNA探測活體標本中分離的核酸， 作為遺傳病診斷， 為神經系統遺傳病的診斷開闢了新途徑。
5、產前診斷 利用妊婦羊水細胞或絨毛細胞作染色體檢查可以確定性別。 若X性連鏈隱性遺傳者均在男孩中罹病， 可為終止妊娠提供指導。 亦可為進一步檢查提供線索， 當性別確定後可作進一步生化酶活性或DNA探針檢測。 如Duchenne肌營養不良症幾乎均發生在男性， 當染色體檢查後， 可有1/2幾率發病。 因此需作CPK（肌酸磷酸激酶）及PK（磷酸激酶）測定。 若結果仍有可疑時可作DNA探針檢測予以產前診斷。
電生理、影像學X線、CT、MRI檢查和病理檢查等， 對診斷及鑒別診斷頗有意義。
