運動神經元病提倡以中醫中藥為主的治療方法。 本病以虛證多見， 或虛實夾雜， 一般的治療原則為補脾益損， 溫養腎陽， 滋補肝血， 養陰祛濕， 其方法有以下幾種。
辨證分型治療
按照中醫傳統的辨證論治方法， 本病可以分為以下證型。
1．脾胃虛損
主證：肌肉萎縮， 肢體萎軟無力， 或有肌肉顫動， 少氣懶言， 語音低弱， 咀嚼無力， 吞咽不順利， 口張流涎， 食少， 便溏， 腹脹， 面色淡白無華。 舌體胖嫩淡， 苔薄白或白膩， 脈細。
治法：補脾益損， 強肌健力。
方藥：補中益氣東加減。
2．脾腎虛損
主證：肌肉萎縮。 肢體萎軟無力， 肌肉時有顫動，
治法：補益脾腎， 強肌健力。
方藥：右歸九合補中益氣東加減。
3．肝腎陰虛
主證：肌束震顫， 肌萎肉削， 大肉瘦脫， 形體消瘦。 筋骨拘攣， 動作益衰， 甚至步履全廢。 大便秘結。 舌紅， 舌體萎軟、薄瘦。 苔少， 脈細數。
治法：滋補肝腎。
方藥：左歸九合六味地黃丸加減。
4．濕熱浸淫， 虛實夾雜
主證：四肢萎軟乏力， 身體困倦沉重， 肌肉跳動， 肢體麻木， 身熱口幹， 胸痞院悶， 小便短赤澀痛。 舌紅， 苔黃膩， 脈弦數。
治法：清熱利濕， 補虛瀉實。
方藥：四妙散加減。
