甲狀腺自身抗體包括甲狀腺微粒體抗體（TMAb）、甲狀腺球蛋白抗體、促甲狀腺激素受體抗體和甲狀腺激素抗體（TAb）。 其中甲狀腺微粒體抗體中有一種叫做甲狀腺過氧化物酶抗體（TROAb)， 其作用相當重要， 是甲狀腺的主要的破壞性抗體， 在甲亢等自身免疫性甲狀腺疾病中水準升高， 是對甲狀腺細胞主要的破壞性抗體。
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