肛瘺治療除外科傳統的手術和掛線外， 近年來國內學者採用中西醫方法和運用高科技的方法治療， 獲可喜成果。 現簡介如下：
(1)冷凍治療 適用於低位單純性肛瘺的治療， 是利用-196攝氏度液氮使瘺道發生凝固性壞死。 繼而脫落， 形成新的創而而自愈。 麻醉下先用刮匙從外口適當搔刮瘺管， 再用探針探入， 確定瘺管的方向和走行， 拔出探頭， 選擇相似形狀的冷凍探頭(彎曲程度不同的紫銅管， 直徑2毫米左右)作接觸法冷凍， 持續冷凍3分鐘， 使整個管道成白色冰棒， 待自然複溫後拔出探頭， 外塗消炎止痛軟膏，
本方法操作簡便、痛苦小、不出血、無肛門失禁等併發症。
(2)電療儀治療 是根據祖國醫學掛線療法的原理， 運用現代肛瘺電療儀的高溫物理技術治療， 利用電弧放電產生高溫， 對局部組織進行燒灼， 以切開肛瘺達到治療目的。 適用於低位肛瘺的治療。 麻醉下用探針搞清瘺管內外口及走行， 用電療儀沿探針依次切開肛瘺管壁， 暴露創面， 外敷燙傷膏。
本方法操作簡便、療程短， 只需電療一次即可治癒。
(3)醫用ZT膠粘堵法 適用低位單純性肛瘺的治療。 麻醉下， 先用探針由外口向內口探入， 確定瘺管的方位， 用小刮匙搔刮並清除管內壞死組織及分泌物。 然後將裝有ZT膠的塑膠管插入瘺管內口， 術者左手食指插入肛門觸及塑膠管頭部後，
本方法操作簡便、痛苦小、治療時間短， 不會引起肛門失禁等併發症。
(4)藥撚脫管法 是祖國醫學的傳統治療之一， 將紅升丹用桑皮紙做成大小長短不一的藥撚。 麻醉下先用刮匙從外口適當搔刮瘺管， 以內口為中心作1×1.5釐米橢圓形切口， 向下清除感染肛竇、肛腺及其導管， 用腸線縫合肌層(內括約肌)， 再將切口上緣粘膜適當游離下拉， 覆蓋創面， 並用細絲線縫合肛管皮膚， 以加強閉合內口， 再視瘺管大小、深淺、長短、選擇適當的紅升丹藥撚插入管道， 外塗金黃膏。 術後全身應用抗生素5—7天， 局部便後坐浴， 每日換紅升丹藥撚一次， 當瘺管膿腐脫淨流血水時(一般需要4—6天)，
本方法簡單、療程短、治癒率高， 對肛門功能保護好等優點。
(5)CO[2]鐳射治療 適用於低值單純性肛瘺， 麻醉下用球頭探針從瘺道外口插入， 沿瘺管走行緩緩探至內口引出肛門外， 將鐳射輸出功率調至25—30W， 從外門沿探針向內門方向逐步完全切開， 再降低功率約15W左右， 將切開的“V”形創面的感染瘺管壁、腐肉等汽化掉， 特別是內口周圍的肉芽組織切勿遺漏。 並向直腸方向延長汽化約0.2釐米， 汽化過程中注意將過厚的炭化層用千分之一新潔爾滅棉球擦去， 以將病灶汽化乾淨為度。 對高位瘺可鐳射結合掛線治療。
本方法具有不出血、視野好、能直接滅菌、手術時間短、創傷小、癒合快等優點。
