胡黃連味苦, 性寒, 屬寒涼藥。 主要有消疳積、退勞熱的作用。 小兒不注意飲食或有寄生蟲病而致傷害脾胃, 影響消化, 漸致疳積(腹大青筋、食欲不振、四肢消瘦, 下午低熱、頭髮乾枯打縷、脾大等), 可用胡黃連配焦三仙、檳榔、炒內金、木香、炒萊菔子、枳實、白術、地骨皮、使君子等同用。 胡黃連也可用於濕熱痢疾, 常配合木香、檳榔、白芍、當歸、白頭翁等同用。 對於陰虛勞熱(下午發熱、手足心熱、人體漸漸消瘦、兩顴發紅), 可用本品配地骨皮、白薇、百部、沙參、青蒿、炙鼇甲、秦艽、生地、元參等同用。 品小兒科使用最多, 常用于小兒身熱驚風、疳積等症。
胡黃連細粉用乳汁浸調點眼能治療肝經風熱所致的目昏、目赤等症, 效果良好。 川黃連清熱瀉火, 偏用於濕熱毒盛、痢疾、瘡毒等實熱證。 胡黃連主用於陰虛發熱、小兒疳積、驚風等症。 用量一般一至三錢。 外感發熱及脾胃虛寒者忌用。