食道癌的鑒別診斷在其治療中起著決定性的作用， 它主要是將食道癌與食管其他良惡性腫瘤相鑒別， 使患者能夠進一步得到最可靠有效的治療。 臨床上常將食道癌與下列疾病進行區分：
1、食管息肉：屬食管良性腫瘤， X線檢查時可見病變部位食管腔呈梭形腫大， 上端食管腔擴張不明顯， 鋇劑在腫瘤表面有分流或偏一側壁通過， 局部管壁擴張和收縮功能良好。 惡變較少見， 惡變時粘膜可見潰瘍面， 需與腔內型食管癌相鑒別。
2、食管賁門失弛緩症：是由於食管神經肌肉功能障礙所致， 多發于女性，
3、食管良性狹窄：食管良性狹窄多由誤吞腐蝕劑、食管灼傷、異物損傷、食管胃手術、也可能是食管炎、慢性潰瘍等引起的瘢痕狹窄所致。 其病程較長， X線或鋇餐檢查可見食管狹窄、粘膜消失、管壁僵硬等現象。
4、缺鐵性假膜性食管炎：多發生於女性， 其症狀除咽下困難外， 還可出現小細胞低色素性貧血、舌炎及胃酸缺乏等表現。
5、食管周圍病變：食管周圍器官病變主要表現為心臟增大、主動脈瘤、縱隔腫瘤、縱隔淋巴結腫大、甲狀腺腫等， X線或鋇餐檢查可顯示食管有光滑的壓痕， 粘膜紋理完好， 與食管癌較容易區分開來。
6、食管良性腫瘤：臨床主要為少見的平滑肌瘤，
7、癔球症：多見於青年女性， 時有咽部球樣異物感， 進食時消失， 常由精神因素誘發。 本病實際上並無器質性食管病變， 與食管癌較易鑒別。
8、食管上皮細胞重度增生：臨床認為食管上皮細胞重度增生屬食道癌的癌前病變， 患者往往可有早期食道癌的症狀。 另外， 十二指腸內容物返流進入食管導致粘膜性的食管炎症， 內窺鏡檢查可發現粘膜糜爛或潰瘍。
9、其他良性腫瘤：如食管顆粒細胞肌母胞瘤、癌肉瘤、食管血管瘤、惡性淋巴瘤、食管腺瘤、惡性黑色素瘤、雀麥細胞癌等，
食道癌的鑒別診斷， 臨床上主要依賴於X線或內窺鏡檢查， 另外， 鑒別食道癌的方法還有上消化道鋇餐檢查、CT檢查及食管管腔內超聲掃描檢查等， 以免發生漏診或誤診， 耽誤患者的治療， 給患者帶來不可挽回的損失。
