血栓性血小板減少性紫癜是一種罕見的血液疾病， 臨床診斷時應注意與下列疾病鑒別：
原發性血小板減少性紫癜
原發性血小板減少性紫癜是一種自身免疫性疾病， 是由於體內產生抗血小板抗體， 使血小板破壞過多， 血小板計數減少， 引起紫癜。 臨床以齒齦出血、鼻腔出血、皮膚出血點或瘀斑、消化道出血為主要表現。 但無溶血現象。 而血栓性血小板減少性紫癜有發熱、溶血及精神症狀， 嚴重者可出現五聯征。
彌散性血管內凝血
彌漫性血管內凝血與血栓性血小板減少性紫癜在臨床表現以及實驗室檢查方面有相似之處。
伊文綜合征
伊文綜合征雖然有血小板計數減少， 臨床有出血現象， 並且有溶血， 但無神經系統症狀， 在外周血中也無破碎紅細胞。 與血栓性血小板減少性紫癜相似之處是兩者都可併發有紅斑狼瘡。
溶血性尿毒綜合征
溶血性尿毒綜合征多發生在10歲以下的兒童， 尤其在乳兒期， 腎臟損害症狀明， 預後較好；血栓性血小板減少性紫癜多發生在年長兒及成年人， 臨床以精神症狀明顯， 腎功能衰竭者少見， 預後較差。
系統性紅斑狼瘡
系統性紅斑狼瘡有關節症狀、腎損害、神經症狀，
並有溶血性貧血、皮膚損害、LE細胞陽性、外周血中無畸形和碎裂紅細胞，
不難與血栓性血小板減少性紫癜鑒別。
