(一)植物藥
將植物作為藥物使用， 主要的藥用部位包括植物的根、莖、葉、花、果實、種子、皮、全草等。 不同的藥用部位其性狀功能、採集加工都各自不同。
(二)動物藥
以動物人藥， 主要包括蛇類藥、蟲類藥、飛禽類藥、魚類藥及貝類藥等動物， 藥用部位包括動物的全體、角、皮、骨、肉、血、內臟以及蜂類的巢、動物的糞便、結石等。
(三)礦物藥
以含有金屬的礦石、金屬、泥土、燃燒後的煙灰等作為藥物使用， 稱為礦物藥。
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