肛裂症狀有明確特點，
只要詳細訊問病史病程，
以及疼痛、出血特點，
診斷並不困難。
但在診斷時，
為了提高診斷的準確性，
防止失誤，
應嚴格按問診、觸診、視診及活體組織檢驗幾個方面加以鑒別診斷。
指診：因括約肌痙攣肛門收緊，
如用力過猛，
常引起劇烈疼痛，
有時須在局麻下檢查。
肛門內摸到的裂口，
急性者邊緣軟，
底淺，
有彈性，
觸之敏感;慢性者邊硬突起，
底深，
無彈性。
視診：急性肛裂肛門部可見分泌物，
牽開臀部可見肛裂下端，
如用探針輕觸裂口的下端，
可引起疼痛;慢性肛裂常見有結締組織外痔。
窺器檢查：可見卵圓形潰瘍， 或見細小裂口。 急性肛裂的裂口邊緣整齊， 底淺紅色;慢性肛裂的裂口邊緣不整齊， 底深灰白色， 有的嚴重肛裂者還可看到括約肌纖維。
鑒別診斷：須與結核性潰瘍、梅毒潰瘍、軟下疳和上皮癌等潰瘍相鑒別。 其中潰瘍性結腸炎和肉芽腫性結腸炎併發之肛裂極易鑒別。
