1.心臟病變
以主動脈瓣病變較為常見， 據屍檢發同約25%AS病例有主動脈根部病變， 心臟受累在臨床上可無症狀， 亦可有明顯表現。
2.眼部病變
長期隨房， 25%AS病人有結膜炎、虹膜炎、眼色素層炎或葡萄膜炎， 後者偶可併發自發性眼前房出血。 虹膜炎易復發， 病情越長發生率愈高， 但與脊柱炎的嚴重程度無關， 有周圍關節病者常見， 少數可先於脊柱炎發生。 眼部疾病常為自限性， 有時需用皮質激素治療， 有的未經恰當治療可致青光眼或失明。
3.耳部病變
Gamilleri等報導42例AS病人中1/2例（29%）發生慢性中耳炎， 為正常對照的4倍， 而且，
4.肺部病變
少數AS病人後期可併發上肺葉斑點狀不規則的纖維化病變， 表現為咳痰、氣喘、甚至咯血， 並可能伴有反復發作的肺炎或胸膜炎。 X線檢查顯示雙側肺上葉彌漫性纖維化， 可有囊腫形成與實質破壞， 類似結核， 需加以鑒別。
5.神經系統病變
由於脊柱強直及骨質疏鬆， 易使頸椎脫位和發生脊柱骨折， 而引起脊髓壓迫症；如發生椎間盤炎則引起劇烈疼痛；AS後期可侵犯馬尾， 發生馬尾綜合征， 而導致下肢或臀部神經根性疼痛；骶神經分佈區感染喪失， 跟腱反射減弱及膀胱和直腸等運動功能障礙。
6.澱粉樣變
為AS少見的併發平。 有報導35例AS中， 常規直腸粘膜活檢發現3例有澱粉樣蛋白的沉積，
7.腎及前列腺病變
與RA相比，
AS極少發生腎功能損害，
但有發生IgAD腎病的報告。
AS併發慢性前列腺炎較對照組增高，
其意義不明。
