1、空腹時不宜食用。
番茄含有大量可溶性收斂劑等成分， 與胃酸發生反應， 凝結成不溶解的塊狀物， 容易引起胃腸脹滿、疼痛等不適症狀。
2、不宜和黃瓜同食。
黃瓜含有一種維生素C分解酶， 會破壞其他蔬菜中的維生素C， 番茄富含維生素C， 如果二者一起食用， 會達不到補充營養的效果。
3、服用肝素、雙香豆素等抗凝血藥物時不宜食。
番茄含維生素K較多， 維生素K主要催化肝中凝血酶原以及凝血活素的合成。 維生素K不足時， 會使凝血時間延長造成皮下和肌肉出血。
4、不宜食用未成熟的番茄。
青番茄含有生物鹼甙（龍葵堿），
5、不宜長久加熱烹製後食用。
長久加熱烹製後會失去原有的營養與味道。
6、服用新斯的明或加蘭他敏時禁食。
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