黃體功能不全的治療分為激素補充療法和刺激黃體療法兩種。 對於高泌乳素血症引起的黃體功能不全， 宜予抑制泌乳素治療。 但是需要注意的是， 治療要在醫生指導下進行， 患者切勿擅自用藥。
孕酮補充療法。 據統計， 孕酮補充療法應用得當， 有48％的妊娠率。 一般以天然孕酮為宜， 因為天然孕酮有良好的促子宮內膜分化作用。 不宜用合成黃體酮， 因為人工合成黃體酮如安宮黃體酮、炔諾酮類有溶黃體作用， 而抑制患者本身黃體激素分泌的缺點。 一般在判斷排卵或BBT升高後 1～3天即開始應用孕酮， 每天肌注12.5 mg，
刺激黃體療法。 絨毛膜促性腺激素是有效的黃體功能刺激劑， 可增加孕酮合成及延長黃體的壽命。 於預計排卵後2～3天用藥， 開始， 隔天肌注HCG 5 000 U， 共3～5次， 連續3個週期為1個療程。 一般注射後次日血中孕酮水準即升高。 有報導約80％的患者有效果。
克羅米芬治療。 理論依據是上述兩藥促使下丘腦分泌LH - RH， 從而使垂體分泌FSH、LH增加， 導致排卵前卵泡的發育和成熟， 使排卵後黃體細胞分泌較多的孕酮。 故對FSH、LH分泌不足引起的黃體功能不全有效，
溴隱亭治療。 對高泌乳素血症引起的黃體功能不全， 給予溴隱亭治療有 一定的療效。
黃體功能不全在臨床表現上以腎虛、肝鬱為主， 或見氣血不足， 或兼痰瘀阻滯， 分為腎虛肝鬱型、腎虛痰濕型、氣血兩虛型、肝鬱血瘀型。 治療重在補腎養血、疏肝解鬱， 亦可用中藥人工週期法。 腎虛肝鬱型治則：補腎疏肝;腎虛痰濕型治則：益腎祛痰;氣血兩虛型治則：益氣養血補腎調經;肝鬱血瘀型治則：疏肝解鬱， 行氣化瘀， 佐以補腎。
