只有當乙肝病人的體內存在病毒複製， 並且病人機體的免疫功能較強時， 使用抗病毒藥物治療， 才會收到理想的療效。 乙肝病毒是否在複製， 只需采血檢查DNA(HBV-DNA)即可。 要想知道乙肝病人體內的免疫功能如何， 只需采血檢查病人的谷丙轉氨酶即可， 穀丙轉氨酶越高， 說明其機體免疫殺傷乙肝病毒的能力越強。
那麼病人的谷丙轉氨酶升到多高時使用抗乙肝病毒的藥物最有效呢?張建軍說， 只有當病人的谷丙轉氨酶升高超過正常值2倍以上時， 使用抗病毒藥物治療才會最有效。
因此， 不論是大、小三陽， 只要乙肝病毒DNA是陽性， 同時穀丙轉氨酶升高超過正常值2倍(人體內穀丙轉氨酶的正常值小於40單位/升)以上， 並在10倍以下時， 就是抗病毒治療的最佳時機。
另外， 有重症乙肝傾向者也要及早進行抗乙肝病毒治療， 這樣可以大大降低死亡率， 但必須同時配合綜合治療措施。
乙肝肝硬化患者如有反復肝功能異常且病毒指標陽性也要抗病毒治療， 臨床研究發現部分代償期乙肝肝硬化經抗病毒治療和抗肝纖維化治療可以逆轉病勢， 阻斷肝硬化的發展。
