強直性脊柱炎的病因尚不明確, 過去曾和類風濕關節炎共同討論過, 下列因素可能與其發病有關。
感染因素:目前, 尚沒有明確的證據證明它與細菌和病毒感染有關, 但有人發現強直性脊柱炎患者體內的人類白細胞抗原可高達90%, 因此, 認為本病與某種病毒或細菌感染有關。
內分泌失調或代謝障礙:由於類風濕關節炎多見於女性, 而強直性脊柱炎多見於男性, 故被認為內分泌失調與本病有關。 但利用激素治療類風濕關節炎並未取得明顯效果。 激素失調與本症的關係亦未能肯定。
家族遺傳關係:類風濕關節炎患者家族的發病率為對照組的2~10倍,