除了肝細胞性肝癌之外， 引起甲胎蛋白升高最常見的原因是肝炎。
這是由於部分肝炎患者的肝細胞再生過程中， 會產生甲胎蛋白， 這種甲胎蛋白升高是暫時性的， 待肝炎活動停止， 肝功能恢復正常後， 甲胎蛋白會恢復到正常範圍。
1.肝癌結節
肝炎引起的甲胎蛋白升高， 其值多小於400ng/ml， 但也有個別患者甲胎蛋白升高明顯， 而原發性肝癌引起的甲胎蛋白升高多大於400ng/ml， 且持續時間長。 如果此時可以通過超聲、CT或核磁共振檢查發現典型的肝癌結節，
2.谷丙轉氨酶
有時， 通過影像學檢查沒有發現明顯的肝癌結節， 這時候的鑒別主要是分析甲胎蛋白和穀丙轉氨酶的絕對值極其動態變化。 應密切隨訪肝功能和甲胎蛋白的情況， 每兩周檢查一次， 將甲胎蛋白和ALT的數值繪成兩條曲線， 一般來說， 甲胎蛋白出現的峰值略晚於ALT， 即兩者趨勢相同， 就是說隨著ALT的降低， 甲胎蛋白隨後降低， 多是肝炎活動;如果兩條曲線分離， 即ALT下降至正常而甲胎蛋白仍持續上升， 則肝細胞性肝癌的可能性較大。
當然肝炎患者發生肝癌的危險性要高於正常人， 即使已經確定甲胎蛋白的升高是肝炎引起的， 也應該密切隨訪， 定期檢查甲胎蛋白和做超聲檢查， 以便能及時、早期發現肝癌，
