可能是需要切斷的三叉神經感覺纖維未被完全切斷, 或感覺後根內有節細胞異位生長, 如做三叉神經感覺根減壓術, 而未切斷感覺根者, 遠期復發率較高。 也有的病例手術後就無效, 特別是行三叉神經周圍支手術有其他病變末被發現者, 如小腦橋腦角處有較小的腫瘤, 異常細小的血管壓迫後根入根區未被發現, 蛛網膜粘連等, 減壓手術後疼痛又復發。 因此, 目前很少有人採用只作根囊切開減壓而不切斷感覺根的術式, 尤其是頑固性三叉神經痛,
三叉神經周圍支酒精阻滯和周圍支切斷撕脫術後, 各學者均報導復發率較高。 其復發原因多因前者為酒精凝固破壞不全。 早在1936年Crant報導用酒精注射三叉神經周圍支治療三叉神經痛229例, 結果全部復發, 此類患者復發後檢查三叉神經分佈區域的感覺並沒有恢復。 這一事實說明, 向三叉神經支內注射酒精, 或將神經支切斷撕脫, 顯然是達不到對本病恒久治癒的目的。 遠期疼痛的復發則與神經纖維的再生或病因的繼續存在或發展的原因有關。
顳部入路手術,
經皮穿刺半月神經節射頻熱凝術, 或注射甘油治療三叉神經痛, 復發率分別為23.3%和4.6%。 復發的原因亦可能是未徹底處理病灶的關係。