在臨床上， 有很多患者認為， 只要患了尖銳濕疣就會癌變， 加上本身對疾病的正確認識不足， 造成患者心理極大的恐慌和壓力。 其實不然， 尖銳濕疣癌變的幾率是非常小的。
在某些自然的或實驗條件下， HPV病毒誘發的尖銳濕疣雖具有轉化為癌的傾向， 然而這種轉化率病不高， 不是所有的HPV感染者都會進展為癌。 對於大多數患者而言， 這種轉化還需要其它輔助因數的存在， 例如吸煙、化學物質、宿主因素(例如HIV感染)和環境協同因素等， 均對尖銳濕疣轉為惡性腫瘤有致突變及啟動作用。 從臨床情況而言，
1、免疫功能降低或身體衰弱時的人體易患尖銳濕疣， 而癌症的發生也與免疫功能有關， 加上某些原因啟動癌基因、免疫狀態改變和某些致癌物質作用， 或皮損融合成片， 長期不愈， 形成潰瘍， 浸潤糜爛， 有繼發感染等慢性刺激， 最終發生細胞突變而轉化為癌。
2、機體免疫功能下降， 復發率高， 採取多種有效治療措施， 仍不能有效控制復發的皮損， 可能向惡性化發展。
3、肛門、直腸及肛周等部位的巨大尖銳濕疣是高度進展性腫瘤， 具有復發和惡變特性， 尤其是向皮膚深層浸潤生長時， 惡變的可能性更大。
