小兒支原體肺炎的治療與一般肺炎的治療原則基本相同， 採取綜合治療措施。 包括一般治療、對症治療、抗生素的應用、腎上腺皮質激素， 以及肺外併發症的治療等5個方面。
1.一般治療
呼吸道隔離 由於支原體感染可造成小流行， 且患兒病後排支原體的時間較長， 可達1～2個月之外。 嬰兒時期僅表現為上呼吸道感染症狀， 在重複感染後才發生肺炎。 同時在感染支原體期間容易再感染其它病毒， 導致病情加重遷延不愈。 因此， 對患兒或有密切接觸史的小兒， 應盡可能做到呼吸道隔離， 以防止再感染和交叉感染。
護理 保持室內空氣新鮮， 供給易消化、營養豐富的食物及足夠的液體。 保持口腔衛生及呼吸道通暢， 經常給患兒翻身、拍背、變換體位， 促進分泌物排出、必要時可適當吸痰， 清除粘稠分泌物。
氧療 對病情嚴重有缺氧表現者， 或氣道梗阻現象嚴重者， 應及時給氧。 其目的在於提高動脈血氧分壓， 改善因低氧血症造成的組織缺氧。 給氧方法與一般肺炎相同。
2.對症處理
祛痰 目的在於使痰液變稀薄， 易於排出， 否則易增加細菌感染機會。 但有效的祛痰劑甚少， 除加強翻身、拍背、霧化、吸痰外， 可選用必嗽平、痰易淨等祛痰劑。 由於咳嗽是支原體肺炎最突出的臨床表現， 頻繁而劇烈的咳嗽將影響患兒的睡眠和休息， 可適當給予鎮靜劑如水合氯醛或苯巴比妥，
平喘 對喘憋嚴重者， 可選用支氣管擴張劑， 如氨茶鹼口服， 4～6mg/(kg·次)， 每6h1次；亦可用舒喘靈吸入等。
