外用抗菌藥物可以聯合其它方法一起使用來治療灰指甲， 這樣可以不僅可以縮短治療過程還可以減少復發。 單純採用一種方法治療灰指甲， 治療失敗率高。 據統計， 按照標準的口服抗菌藥物治療在3年內復發率高達22.2%。 因為不同的抗真菌藥物有不同的作用機制， 因此採用聯合治療灰指甲的方法可以互相取長補短， 增加治療效果， 特別對難治的病例同時採用幾種方法協同作戰能夠達到事半功倍的效果。
1.聯合用藥的模式
聯合治療灰指甲， 可採用幾種口服抗真菌藥物聯合， 例如同時服用特比萘芬和伊曲康唑；還可以採用局部外用抗真菌軟膏與口服抗真菌藥物聯合；另外還有口服抗真菌藥物和外科拔甲治療聯合以及外用抗菌軟膏與外科拔甲聯合。
2.聯合治療灰指甲的效果
根據文獻報導， 阿莫羅芬塗甲劑與口服抗真菌藥聯合治療， 其治癒率比單純使用阿莫羅芬的效果有顯著提高；除此之外， 外科拔甲之後加用灰黃黴素粉， 灰指甲的治癒率可達七成以上；拔甲之後聯合外用抗真菌藥物封包， 封包可以增加抗真菌藥物的滲透， 比不封包的療效明顯要高很多；如果採用化學拔甲的方法， 那麼聯合口服抗真菌藥物進行治療效果會更好。 對於特殊型和難治型的灰指甲， 採取聯合用藥的方法可以提高治癒率，
