動物糞便中的弓形蟲等寄生蟲會在鞋架上存活數天， 如果手接觸到它們， 再進入嘴裡， 嚴重的會致盲。 即使鞋子上沒有任何危險的病原體， 當你的手接觸到鞋架或無意接觸鞋底時， 也會沾染到細菌。 另外， 櫃式的鞋架， 由於長期封閉、黑暗、潮濕、不通風等， 更容易使櫃內以及鞋內細菌滋生， 從而引起腳氣、腳臭等。
專家建議：在門口放一個腳墊， 進門前將鞋子上的灰塵、泥土清理掉再放到鞋架上， 有條件的住戶， 還可以將鞋架放置在門外， 放幾雙近期常穿的鞋子;脫鞋之後， 應及時把手徹底洗乾淨;定期用半濕的抹布擦一下鞋架，
國家室內環境質檢中心主任宋廣生告訴記者， 選鞋架時， 最好選擇敞開式、可拆洗的， 方便清洗除菌。 如果是櫃式的鞋架， 買後應勤通風換氣， 還可以在裡面適當放些吸附劑， 如活性炭、乾燥劑等。 選擇木質鞋架時， 要注意用料安全， 人造木板甲醛含量應符合國家標準。 塑膠鞋架和木質鞋架不能放在陽光直射的地方， 否則容易老化乾裂。 如果是安置在陽臺等室外區域， 建議選擇金屬鞋架， 使用壽命更長。 木質鞋架受潮易變形， 平時要保持乾燥， 可以適當用專門的護理劑擦，
