本病應與下列疾病作鑒別：
（一）慢性胃炎 本病亦有慢性上腹部不適或疼痛其症狀可類似消化性潰瘍但發作的週期性與節律性一般不典型胃鏡檢查是主要的鑒別方法
（二）膽囊炎膽石病 多見於中年女性常呈間隙性發作性右上腹痛常放射到右肩胛區可有膽絞痛發熱黃疸Murphy征進食油膩食物常可誘發B超檢查可以作出診斷
（三）胃癌 胃良性潰瘍與惡性潰瘍的鑒別十發重要其鑒別要點見表18-10兩者的鑒別有時比較困難以下情況應當特別重視：①中老年人近期內出現中上腹痛出血或貧血；②胃潰瘍患者的臨床表現發生明顯變化或抗潰瘍藥物治療無效；③胃潰瘍活檢病理有腸化生或不典型增生者臨床上對胃潰瘍患者應在內科積極治療下定期進行內鏡檢查隨訪密切觀察直到潰瘍癒合
（四）胃神經官能症 本病可有上腹部不適噁心嘔吐或者酷似消化性潰瘍但常伴有明顯的全身神經官能症狀情緒波動與發病有密切關係內鏡檢查與X線檢查未發現明顯異常
（五）胃泌素瘤 本病又稱Zollinger-Ellison綜合征有頑固性多發性潰瘍或有異位性潰瘍胃次全切除術後容易復發多伴有腹瀉和明顯消瘦患者胰腺有非β細胞瘤或胃竇G細胞增生血清胃泌素水準增高胃液和胃酸分泌顯著增多
