由於肝組織損傷嚴重， 體內毒物產生過多， 肝臟解毒功能喪失， 或使腦對體內毒素敏感性增加， 促進了肝昏迷的發生。
發生肝昏迷的原因有以下幾個方面：
1、消化道出血
肝硬化時會發生食道或胃底靜脈曲張破裂出血， 使門靜脈血流減少， 肝臟明顯缺氧， 則肝損加重；另一方面， 血液流到腸道被細菌分解後又產生大量的氨， 進入血中發生氨中毒。
2、利尿劑的應用
肝硬化腹水病人常用利尿劑， 雙氫克尿塞的應用可導致低鉀或低鉀性堿中毒， 結果會增加腎靜脈的含氨量， 使血氨增加；另外， 大劑量的利尿劑利尿，
3、鎮靜劑與麻醉劑的應用
這類藥物直接對肝、腦有毒性作用， 可加重腦組織缺氧。
4、大量放腹水
可導致電解質嚴重紊亂， 蛋白質大量丟失， 或因穿刺放腹水後腹腔內壓驟減， 門靜脈瘀血， 肝內缺氧而加重肝損害。
5、攝入蛋白質食物過多
大量蛋類、肉類、乳製品等在腸內經細菌分解產生氨， 進入血中使血氨升高。 因為蛋白質需在肝內代謝， 蛋白質攝入過多， 必然加重肝臟損害， 造成損傷。
6、感染
肝硬化合併腹膜炎、敗血症、肺炎等疾病， 可加重肝損傷， 也因細菌感染， 使組織分泌增強， 導致氨大量增加， 或因微生物毒性作用于肝臟， 加重肝損害。
7、便秘
肝硬化病人排便不暢，
中醫認為， 急性肝昏迷的原因主要是濕熱結痰， 痰熱蘊毒， 毒火攻心以致內蘊， 由於毒熱勢急， 迅速耗灼氣陰， 因此， 開始多屬實熱， 但很快出現正虛之象。 臨床上可分為痰熱偏盛和痰濕偏盛兩類。
慢性肝昏迷多因久病體虛， 氣血不足， 陰陽俱損， 肝陰不足， 血不養肝， 虛風內動；另外， 濕毒熱邪潛伏血分， 進一步發展能鼓動虛風， 邪正交爭， 以致時而意識昏蒙、煩躁易怒、視物不清、頭暈健忘、疲乏嗜臥等， 且多由憂鬱或過勞而致痰迷竅團、神志昏迷等。
