現代藥理研究表明， 黃連含有小蘖堿、黃連堿、甲黃連堿及棕櫚堿等化學成分， 具有較強的抗菌作用， 同時還有降血壓、擴張血管、降血糖、利膽、解熱、抗炎、強心、促進組織癒合、利尿、鎮痛、鎮靜、降低眼內壓、抗癌等作用。
黃連是以“苦”著稱的中藥， 性寒， 味苦， 傳統上多用於腸胃濕熱所致的腹瀉、痢疾、嘔吐、熱盛火熾、煩躁、癰腫瘡毒等症。 現代藥理研究表明， 黃連含有小蘖堿、黃連堿、甲黃連堿及棕櫚堿等化學成分， 具有較強的抗菌作用， 同時還有降血壓、擴張血管、降血糖、利膽、解熱、抗炎、強心、促進組織癒合、利尿、鎮痛、鎮靜、降低眼內壓、抗癌等作用。
治療高血壓 每天0.75～4克， 分3～4次口服， 6～14天為1療程。 黃連中的黃連堿具很廣的抗菌譜， 能抑制鏈球菌， 又能擴張血管。 若用於腎炎高血壓及高血壓伴心絞痛的患者， 能夠收到雙重效果。
治療心律失常 每天4次， 每次口服0.4克。 顯效後逐漸減至維持量：若服藥5～7天仍無效或未有顯效者， 則加量至0.5～0.6克， 每日4次， 2～4周為1個療程。
治療2型糖尿病 每日口服黃連素片3次， 每次0.3～0.5克。
治療萎縮性胃炎黃連500克， 食醋500毫升（以瓶裝醋為優）， 白糖500克， 山楂片1000克， 加開水4000毫升， 混合浸泡7日便可服用；每日3次， 每次50毫升， 飯後服。 連續服用90～150天見效。
治療潰瘍性結腸炎 其一是將黃連粉在乙狀結腸鏡窺視下， 直接噴到潰瘍或病變部位， 每次用藥1.8～2.4克， 隔日1次，
治療白喉 每次口服黃連粉0.6克， 每日4～6次， 並配合1%的黃連溶液漱口。 用藥後體溫在1～3天內能恢復正常， 假膜平均2.6天消退， 咽拭培養平均2.8天轉陰。
治療腳濕氣黃連10克打碎， 以開水250毫升浸泡， 冷卻後洗淨患腳， 亦可用棉簽蘸浸泡搽之， 每天早晚各1次。 如有劇癢， 可用棉簽浸泡擦洗， 但不可用手抓搔。 用藥期間需保持患處乾燥清潔， 不可穿膠質鞋。 一般5～12天便能痊癒。
治療麥粒腫 黃連15克打碎， 放入瓶內， 然後把乳汁擠入， 以浸沒藥物為度， 浸泡1天， 濾出乳汁， 點塗患處， 每天3～4次。 一般用藥後次日紅腫漸消， 疼痛減輕；3天后紅腫全消而痊癒。
