仲景在《傷寒雜病論》序言中說他是“勤求古訓， 博采眾方”， 撰用了素問九卷， 八十一難， 陰陽大論， 胎臚藥錄， 並平脈辯證等書， 寫成傷寒雜病論十六卷。 由此可以看出， 《傷寒論》的學術淵源本於內， 難二經， 書中六經之名就是出於《內經·熱論》， 但在理論上又有進一步發展。 它借用古代六經名詞， 創造性地把它運用到外感熱性病的辨證中去， 形成了一套完整的、系統的、科學的辨證體系。
《傷寒論》的六經辨證雖說在某些地方與《內經》六經相同， 但是在很大程度上是借其名而擴其意， 二者存在著許多不同之處， 具體分述如下：
病因《內經·熱論》的六經病側重於熱邪為患， 而《傷寒論》既談中風， 又談傷寒， 亦談溫病， 六氣傷人皆有。
辨證論治《內經·熱論》的六經只論熱證， 不論寒證， 只言實證， 不言虛證， 只重經絡， 不重臟腑， 治法僅限於汗下兩法。 而《傷寒論》的六經則是既有熱證， 又有寒證， 既有虛證， 也有實證， 既重視經絡．更強調臟腑， 其治法是汗、吐、下、和、溫、清， 補， 消八法俱全， 形成了理法方藥完整的六經辨證體系。
發病形式《內經·熱論》只限於兩感。 而《傷寒論》則是合病、並病、直中、兩感等面面俱到， 符合臨床實際。
傳經《內經·熱論》提封“傷寒一日， 巨陽受之一， 二日陽明受之二， 三日步陽受之三， 四日太陰受之四， 五日少陰受之五， 六日厥陰受之六。 ”其意是日傳一經，
綜上所述， 可以看出《傷寒論》的六經是在總結前人經驗的基礎上發展起來的， 無論在理論上或是在臨床上都有了進一步的補充和提高。 但是這絲毫沒有貶低《內經·熱論》對熱性病理論和治療上的貢獻。
