選藥組方的目的是：第一， 增強藥物的協同作用， 以提高臨床療效， 例如黃柏、知母同用， 可使滋陰降火的功效顯著提高；第二， 適應病情的需要， 更好地照顧比較複雜的病證， 如四君子湯是治療脾胃氣虛的常用方荊， 若兼見氣滯痰濕者， 需加陳皮、半夏以理氣燥濕化痰， 名六君子湯， 從而擴大了治療範圍；第三， 調和偏勝， 制約藥物的烈性或毒性， 以消除或緩和對人體的不利因素， 如檳榔和常山配伍後， 可以減弱常山的致嘔作用。 總之， 選藥組方要有利於臨床治療的需要， 使方劑的配伍更加科學， 並具有更明確的目的性。
那麼怎樣組方呢？組成一個方劑， 不是把藥效相同的藥物堆砌在一起， 而是根據病情的需要， 在辨證立法的基礎上， 選擇適宜的藥物， 規定必要的劑量， 接著組方原則配伍而成的。 這種組方原則始見於《內經》， 即“君、臣、佐、使”。 君藥是指標對病因或主證而一起主要治療作用的藥物， 如麻黃湯中的麻黃。 臣藥是指協助君藥以加強治療作用的藥物， 如麻黃湯中的桂枝。 佐藥有三個意義：其一， 治療兼證或次要症狀的藥物， 如麻黃湯中的杏仁；其二， 因君藥有毒或藥性峻烈需加以制約者， 如十棗湯中的大棗；其三， 反佐作用， 反佐是特定的用法， 它是“甚者從之”的意思， 即用與主治藥的藥性相反的藥物作為誘導輔佐， 如四逆加豬膽汁湯中的豬膽汁，
另外， 具有調和藥性的藥物也叫使藥， 如麻黃湯中的甘草。 在每千方劑中， 君藥是不可缺少的。 在簡單的方劑中， 臣、佐、使藥則不一定都具備， 因為有的方劑中的君或臣藥本身就兼有佐， 使藥的作用。 也有些方劑由於組成比較龐雜， 而以生、次藥來區別， 不分君、臣、佐、使。 至於一方中藥味的多少， 《素問·至真要大論》雖有“君一臣二， 制之小也；君一臣三佐五， 制之中也；君一臣三佐九， 制之大也”和“君一臣二， 奇之制也；君二臣四， 偶之制也”的記載， 但並不是呆板的規定， 在臨床上應根據辨證立法的需要而定。
