本病的基本病理變化是全身小血管（包括小動脈， 小靜脈和毛細血管）， 廣泛性損害， 血管壁內皮細胞腫脹、變性， 重者管壁可發生纖維蛋白樣壞死和破裂等， 內臟毛細血管高度擴張， 瘀血， 管腔內可見血栓形成， 引起各組織、器官的充血、出血、變性， 甚至壞死， 腎臟、腦垂體前葉、腎上腺皮質、右心房內膜、皮膚等處病變尤為顯著。 炎性細胞雖也存在， 但不明顯， 一般以淋巴細胞、單核細胞和漿細胞為主。
心臟：右心房有特徵性的內膜下大片狀出血， 左心房和左心室的出血則遠較右心房為輕， 可能與右心房壓力較低，
腎臟：腎臟腫大， 脂肪囊有水腫及出血， 尤以皮髓交界處最為嚴重， 二者分界明顯乃病理特徵之一。 由於小血管的廣泛損害， 血漿外滲， 血液濃縮， 入球動脈發生痙攣， 促使皮髓質間動靜脈短路開放， 以致髓質血管極度擴張充血， 尤以皮髓交界處的直小動脈較為嚴重。 鏡下見腎小球基膜增厚， 腎小管明顯腫脹， 變性和壞死， 管腔變窄和閉塞。
腦下垂體：特點是前葉出血壞死。
腎上腺：主要表現為皮質囊狀帶細胞類脂脫失， 偶有散在性灶性壞死。
氣管和肺：氣管和支氣管粘膜有散在性出血點， 鏡下見肺泡壁毛細血管極度擴張瘀血，
胃腸道：胃粘膜呈彌漫性出血， 十二指腸和空腸上段亦有散在出血點， 小腸下段和結腸出血點顯著減少。
肝：部分肝細胞有脂肪變， 並有散在灶性壞死。
腹膜後膠凍樣水腫是本病的特徵， 乃毛細血管靜脈端壓力升高和血管通透性增加， 大量血漿滲漏所致。
