阿米巴肝膿腫的症狀發熱多見, 有時甚至以發熱為首發症狀, 成為發熱待查中的重要疾病之一。 發熱時體溫多在39℃以下, 有時可為低熱, 但也有高達40℃者, 發熱時大多清晨較低、午後較高, 常夜間熱退, 伴以大汗。 發熱多為持續性, 也可為間歇性者。 發肝區痛:為本病重要而較早出現的症狀, 具有重要的診斷價值。 疼痛性質和程度不一, 與膿腫距肝包膜之遠近、膿腫發展之急緩以及患者的痛閾有關。 疼痛和膿腫大小無平行關係, 有的膿腫雖然很大, 但發展緩慢, 離肝包膜較遠時疼痛可不明顯;反之, 有的僅為小膿腫,
可有乏力、噁心、嘔吐、食欲不振等, 10%~20%患者既往或患病時有腹瀉, 伴胸膜、肺合併症者可有咳嗽。