弓形體病預後和蟲株毒力及受感染者的感受性有關。 先天性弓形體病的預後多較嚴重， 不治療的病例的病死率約12%。 先天性弓形體病最常見的後遺症為視網膜脈絡膜炎， 其次為腦內鈣化、精神障礙、腦積水、小腦畸形和抽搐等。
獲得性弓形體病如及時治療， 預後多較好。 中等度急性獲得性弓形體病如不治療， 淋巴結腫大等症狀可持續數月， 但多無不良後果而自然消退。 特異性治療可以縮短病程。 在多器官被侵犯的， 特別有免疫抑制的病例， 後果非常嚴重。
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