原發性甲狀腺功能減退症(甲減)是最常見類型, 大概是自身免疫性疾病, 通常發生是由於橋本甲狀腺炎, 常常伴有堅實的甲狀腺腫大, 過後, 隨著病程發展, 出現縮小的纖維性甲狀腺, 無或很少有功能。 第二個多見類型是治療後甲減, 尤其因甲亢進行放射性碘和外科治療。 丙硫氧嘧啶, 他巴唑和碘過度治療甲減, 終止治療後往往恢復。 輕度甲狀腺功能減退常見於老年婦女。
大多數伴有非橋本甲狀腺腫病人甲狀腺功能正常或有甲亢, 但甲狀腺腫大甲減可發生于地方性甲狀腺腫病人。 缺碘會減少甲狀腺激素合成;TSH釋放,
繼發性甲減發生於當下丘腦TRH分泌缺乏, 下丘腦垂體軸衰竭或垂體缺乏TSH分泌時。