運動神經元病起病緩慢， 病程也可以呈亞急性， 病狀依受損部位而定， 由於運動神經元疾病選擇性侵害脊髓前角細胞， 腦幹顱神經運動核以及大腦運動皮質錐體細胞、錐體束。 因此若病變以下級運動神經元為主稱為進行性脊髓肌萎縮症：若病變以上運動神經元為主稱為原發性側索硬化；若上、下運動無損傷同時存在， 則稱為進行性延髓麻痹。 臨床進行性脊肌萎縮症、肌萎縮側索硬化最為常見。
（1）進行性脊肌萎縮症（PSMA）：臨床常見病變始于頸下段和胸上側面的前角神經細胞。 首發症狀為一側或雙側手指逐漸無力、僵硬、手掌肌肉萎縮，
（2）肌萎縮側索硬化症（ALS）：臨床較常見有資料統計發病率為4-6%萬約5%-10%屬常染色顯性遺傳， 絕大多數在40歲以後得病 隨年齡的增高發病率有新增加， 此病的特點是上運動神經元和下運動神經元都受損害， 患者雙上肢既有肌萎縮和肌肉震顫， 又有深反射亢進， 雙下肢常見痙攣性癱瘓。 如病變損及腦幹則同時有吞咽困難， 構音不清， 舌肌萎縮和無力， 又有下頜反射亢進以及強哭和強笑等症狀。 肌萎縮側索應化症由於預後較差， 臨床治療難度大， 是目前神經肌肉疾病研究的重點課題材之一。
（3）原發性側索硬化症（PLS）：比較少見，
（4）進行性延髓麻痹（PBP）：最初是舌肌運動易疲乏， 後則有方語不清， 吞咽困難， 吞水是有嗆出。 檢查時可見舌不能伸， 舌肌萎縮有肌肉震顫， 有時可有咀嚼肌及面肌癱瘓和萎縮， 此型比較少見。
