JAK2與JAK1、JAK3和TYK2同屬於JAK家屬， 為非受體型即細胞內激酶。 JAK2突變是體細胞的， 發生於造血幹細胞水準， 僅在造血幹細胞中獲得， 因此是克隆標誌。 突變的JAK2均在來源於CD34＋細胞的髓系細胞（如骨髓細胞、粒細胞、血小板和原紅細胞）中發現， 而在T細胞中則未發現。 另外， JAK2突變主要在造血祖細胞的造血幹細胞集落中發現， 相反該突變在絕大多數的非造血幹細胞中並不存在。 V617F突變位於JAK2的JH2假激酶區， 此與該激酶活性的抑制有關。 JAK2基因突變在Ph－MPD（PV、ET和IMF）中是常見的。 在AML/CML中有少量表達， 而淋系惡性腫瘤中為陰性。 說明JAK2-V617F與PV、ET和IMF的發病是密切相關的。
骨髓增殖性疾病（MPD）患者中JAK2基因（V617F）突變發生率非常高， 約80%的PV， 以及50%的ET和IMF患者含有該突變。 JAK2蛋白是一種細胞質酪氨酸蛋白激酶， 促進細胞內信號的級聯放大。 JAK2基因發生V617F突變後， 使JAK2蛋白持續磷酸化和活化， 被認為增加了紅細胞生成素的敏感性， 以及不依賴紅細胞生成素的髓系造血幹細胞的存活， 進而導致不受控制的細胞增殖。 JAK2基因V617F突變檢測是MPD可靠的鑒別診斷方法， 將MPD與其它先天性或獲得性紅細胞增多症， 原因不明血小板增加， 起源不明的骨髓纖維化等疾病區別開。 JAK2基因V617F突變水準變異較大， 有報導JAK2基因突變水準與疾病的症狀和預後存在一定相關性。
