相當流行的三合一即溶咖啡是工業化的合成品, 主要由砂糖、脂類咖啡伴侶和咖啡組成, 營養成分不如新鮮咖啡豆泡制出來的傳統咖啡好, 脂肪和糖分較高, 優質蛋白及咖啡因較低, 生產過程中可能會失去咖啡的精華。
對於肥胖者和正在減肥的人來說, 雖然有少量報導指出咖啡有減肥的功效, 但也不能多喝。 因為咖啡因會促進消化液的分泌, 增進食欲, 加速食物的消化和吸收。 尤其是三合一即溶咖啡, 含糖和脂肪成分較高, 小心越喝越胖。 懷孕和哺乳期的婦女, 應慎喝咖啡, 以免對胎兒和新生兒造成不良影響。
老年人如果患有腦血管疾病或糖尿病, 應儘量少喝咖啡。 雖然咖啡因有強心作用, 但同時也會加快心跳率, 容易引起心肌缺氧。 如果是身體健康的老人, 除了保證喝咖啡不要過量外, 還應注意要適當補充高鈣食物或鈣劑, 以免骨質疏鬆加劇。
不要在空腹時喝咖啡, 因為咖啡會刺激胃酸分泌。 有胃病的人, 尤其是有胃潰瘍的人更應謹慎。 飲用咖啡的溫度不宜太高, 最佳溫度是 70-80 攝氏度, 在此溫度下, 咖啡的營養物質最穩定, 不易分解, 而且口感最佳。