瑤藥根據傳統、藥用部位、性狀功效等作為命名依據。
根椐不同藥用部位瑤語命名:盤語稱草力“味”, 木(樹)為“亮”, 藤為“美”, 果為“表”、花為“綁”, 塊根為“台”等。 據瑤醫“老班藥”按其功用、生存環境、生態命名:有“五虎”、“九牛”、“十八鑽’、“七十二風”之稱。 如“大接骨風、“刺手風”等。
根據植物形態命名:如“紅帽頂(紅背山麻杆)”、“雞穿褲”(仙鶴草)等。
根據藥材性狀命名:如“枰托藤”(兩廣獼猴桃)、紅絲線(茜草根)等。
根據藥物功效命名:如“十全大補”(假木通)、拾板救(雞骨香)等。