慢性腸炎可能由急性腸炎遷移或反復發作而來， 病程多在2個月以上。 長期過度疲勞、情緒激動、過度精神緊張， 加以營養不良， 都有可能引起慢性腸炎的原因， 慢性腸炎急性發作時， 可能會發高熱、腹部絞痛、噁心嘔吐、大便急迫等。 慢性腸炎病人多半身體虛弱、抵抗力差， 因而更應注意飲食衛生， 不吃生冷、堅硬及變質食物， 不喝酒， 不吃辛辣刺激食物。
在治療慢性腸炎時， 如果是病菌感染性的慢性腸炎， 可以採取的是病原治療的方法。 根據不同的病菌採用不同的抗菌藥。 當然， 對於有的病菌來說， 很輕微時，
慢性腸炎治療重點不在藥物， 而在於平常的飲食。 只有通過精神調適和改變行為等方式， 才能從根本上調整胃腸道功能紊亂。 傳統治療上應用飲食療法、保持心情愉快對症狀也是有幫助的。
飲食應選用易消化的優質蛋白質食品， 如魚、蛋、豆製品及富含維生素的新鮮嫩葉菜等。 最好食用菜汁。 因為慢性結腸炎病人消化吸收功能差， 應採用易消化、半流、少渣飲食， 少量多餐， 以增加營養， 改善症狀。
患者在日常生活中應加強飲食衛生和水源管理;不吃腐敗變質的食物， 不喝生水， 生吃瓜果要燙洗， 要養成飯前便後洗手的良好習慣。
