原發性膽汁性肝硬化又稱肝內梗阻性膽汁性肝硬化。 本病主要病變是肝內小膽管的非化膿性炎症和梗阻。 其病因至今不明， 一般認為本病是一種自身免疫性疾病。 以T細胞介導的免疫反應攻擊小葉內膽管為特徵。 致病因數對膽管上皮細胞的持續攻擊導致膽管結構逐漸破壞而消失。 持續不斷的小葉內膽管消失將引起膽汁淤積的症狀和體征， 隨著疾病是進展， 最後出現肝硬化和肝功能衰竭。 本病常與其他自身免疫性疾病如類風濕關節炎、乾燥綜合征、硬皮病、慢性淋巴細胞性甲狀腺炎等並存。
患者可出現免疫球蛋白增高（IgM增高尤為明顯）， 以及線粒體抗體、抗核抗體、膽管細胞抗體等自身抗體陽性， 均提示本病與自身免疫有關。 現有人認為本病病因基礎是對組織相容性抗原的異常免疫反應。
肝腫大是本病的主要病理表現， 肝臟重量可達1500-2500g， 呈深綠色， 邊緣鈍， 硬度增加， 表面平滑和略有不平。 膽囊常無異常， 囊內常有中等量不含膽鹽的無色澄清液體， 肝內膽管及肝外大膽管均無明顯改變。 由於網狀內皮細胞增生， 肝脾高度腫脹， 並有顯著纖維性變， 脾竇擴張和脾髓內皮細胞增生。 肝門和膽總管旁淋巴結可見腫大。 腎臟腫脹， 遠曲管有不含鐵質的棕色管型。 所有內臟均為膽色素所染。 肝臟組織病理變化可分為4期：
第1期（膽管炎期）主要為肝小葉間膽管或中隔膽管的慢性非化膿性炎症， 膽小管管腔、管壁及其周圍有淋巴細胞、漿細胞、組織細胞和少數嗜酸粒細胞浸潤， 而使匯管區擴大， 約半數病例在匯管區內有淋巴濾泡和典型的肉芽腫形成。 肝細胞和肝細胞界板很少有破壞， 肝小葉結構完整， 無膽汁瀦留現象。 第2期（細小膽管增生期）特點為小膽管增生， 小葉間膽管消失， 其周圍有炎症細胞或成纖維細胞， 因此稱為小膽管周圍炎。 肝細胞多正常， 但在炎變匯管區周圍的肝細胞有淤膽現象。 小葉周圍毛細膽管擴張， 微絨毛喪失、縮短或水腫， 線粒體膨大。 第3期（斑痕期）炎症減輕， 遺留下星狀斑痕， 匯管區的斑痕組織向另一匯管區或肝小葉內伸展。
臨床上本病多見於40-60歲的女性， 男女發病率之比為1：9。 起病隱襲， 早期症狀輕微， 病人一般情況良好， 食欲與體重多無明顯下降。 約10%的患者可無任何症狀。 本病病程呈緩慢進行， 常見臨床表現有：
慢性進行性梗阻性黃疸：膽小管的炎性梗阻可產生不完全性梗阻性黃疸。 早期患者可無明顯黃疸， 但由於血中膽鹽濃度增高， 刺激末梢神經而有皮膚瘙癢， 病久後則有皮膚粗糙， 色素沉著， 脫屑與增厚， 大多在瘙癢出現後0.5-2年後才出現臨床黃疸， 約25%病人瘙癢與黃疸同時出現。
脂肪代謝紊亂：由於腸道缺乏膽鹽， 影響食物中脂肪的乳化與吸收， 引起脂肪瀉。 脂肪瀉往往影響脂溶性維生素A、D、K和鈣的吸收， 並引起營養不良。 由於維生素D的缺乏和鈣的吸收障礙， 可產生骨質軟化、骨質疏鬆， 甚至骨折， 患者常感腰背和肋骨等處疼痛。 由於膽道梗阻， 血清脂類總量和膽固醇含量持續增高， 組織細胞吞噬多量膽固醇而形成黃疣。 黃疣常見於眼瞼內眥， 少見於其他部位。 當肝功能衰竭， 膽固醇合成障礙， 血清膽固醇濃度下降時， 黃疣也可縮小， 甚至消失。
肝脾腫大：由於長期膽汁淤積， 肝臟常顯著腫大， 最大者下緣可平臍， 質硬， 無壓痛， 表面光滑或呈細顆粒狀。
皮膚黏膜出血傾向：可能原因有：維生素K和凝血因數VII缺乏；毛細血管脆性增加；脾亢引起血小板減少。
晚期出現肝硬化和肝功能衰竭的各種表現：如蜘蛛痣、食管和胃底靜脈曲張破裂、腹水和肝性腦病等。
伴隨疾病：常見者有乾燥綜合征、硬皮病、腎小管酸中毒、類風濕關節炎、自身免疫性甲狀腺炎等。
實驗室檢查發現， 幾乎所有PBC的患者均可出現ALP增高， 常可高到驚人的程度， 而且是肝源性的， 血清5‘-核甘酸酶和GGT水平常與之平行升高。 血清轉氨酶水準可以正常或輕度升高， 但很少超過正常高限的5倍以上， 它們波動的範圍也很小， 與預後之關係不大。 通常在PBC的疾病早期， 血清膽紅素水準是正常的， 但隨著病情進展，60%的患者會升高，包括直接膽紅素和間接膽紅素均可升高。膽紅素升高提示預後不良。
最近一項研究提示，出現AMA陽性，遲早會發生PBC。該研究追訪了29例該抗體陽性，但無PBC症狀，而且肝功正常者，行肝活檢病理檢查提示，雖不能診斷，但其中24例的病理改變符合PBC的表現。此後10年的隨訪中，76%的患者出現了PBC的臨床表現，83%出現了膽汁淤積的實驗室異常。有10例患者重複了肝組織病理檢查，結果2例從Ⅰ期病變進展至Ⅱ期，另2例從Ⅰ期病變進展至Ⅲ期，其餘6例病理變化無進展。
PBC可出現血脂顯著升高，至少50%的患者可出現血膽固醇增高，在有黃瘤的患者，其膽固醇水準可高達26mmol/L。在疾病早期，常表現為LDL和VLDL輕度增高，而HDL明顯增高，這就是為什麼PBC的患者雖血脂顯著增高，而因動脈粥樣硬化而發生死亡的危險性並未相應增高的緣故。但到疾病晚期，LDL會逐漸升高，而HDL則減低。PBC還有另一項保護性因素就是低脂蛋白血症，脂蛋白增高是冠狀動脈病變的獨立危險因素。
本病的治療應包括兩方面：針對慢性膽汁淤積引起的症狀和併發症，包括止癢，控制代謝性骨病，糾正高膽固醇血症、維生素缺乏和貧血，改善吸收和營養障礙以及治療甲狀腺疾病等。針對致病因數對肝小葉膽管的破壞。
但隨著病情進展，60%的患者會升高，包括直接膽紅素和間接膽紅素均可升高。膽紅素升高提示預後不良。
最近一項研究提示，出現AMA陽性，遲早會發生PBC。該研究追訪了29例該抗體陽性，但無PBC症狀，而且肝功正常者，行肝活檢病理檢查提示，雖不能診斷，但其中24例的病理改變符合PBC的表現。此後10年的隨訪中，76%的患者出現了PBC的臨床表現，83%出現了膽汁淤積的實驗室異常。有10例患者重複了肝組織病理檢查，結果2例從Ⅰ期病變進展至Ⅱ期，另2例從Ⅰ期病變進展至Ⅲ期，其餘6例病理變化無進展。
PBC可出現血脂顯著升高，至少50%的患者可出現血膽固醇增高，在有黃瘤的患者，其膽固醇水準可高達26mmol/L。在疾病早期，常表現為LDL和VLDL輕度增高，而HDL明顯增高，這就是為什麼PBC的患者雖血脂顯著增高，而因動脈粥樣硬化而發生死亡的危險性並未相應增高的緣故。但到疾病晚期，LDL會逐漸升高，而HDL則減低。PBC還有另一項保護性因素就是低脂蛋白血症，脂蛋白增高是冠狀動脈病變的獨立危險因素。
本病的治療應包括兩方面：針對慢性膽汁淤積引起的症狀和併發症，包括止癢，控制代謝性骨病，糾正高膽固醇血症、維生素缺乏和貧血，改善吸收和營養障礙以及治療甲狀腺疾病等。針對致病因數對肝小葉膽管的破壞。
