肛瘺是發生於肛門附近及直腸下部的瘺管。 肛瘺一般由內口、外口和瘺管三部分組成。 內口多數在肛管齒線附近的肛竇內；外口在肛門周圍皮膚上， 有時不止一個；瘺管壁是由纖維結締組織構成。
①外口：是肛門周圍膿腫破潰或切開的口， 在肛門周圍的皮膚上， 多數距肌門約2～3cm。 其距肛門遠近不定， 數目不一， 可凹陷， 也可突起;可伴有肉芽組織， 紅紫色， 潛行性邊緣， 形狀整齊， 且外口較大者多為結核性瘺管。
②瘺管：連接內口與外口的管道， 形狀各異， 可有一個， 也可有多個分支。
③支管：主瘺管引流不暢， 或反復感染， 均可發生很多支管。 探清支管對手術效果極為重要。
④內口：是肛門感染形成肛門周圍膿腫的入口， 多數在肛竇附近， 80%在肛管後正中線兩側的肛竇發生。 由坐骨直腸窩和肛門部來的血管， 在肛管後方正中線兩側進入直腸， 感染常沿血管周圍蔓延， 因此， 內口多在肛管後部中線兩側。
