口腔潰瘍是日常生活中的常見症狀， 一個人一生中或多或少會碰到。 有不少藥物也可以誘發或直接導致口腔潰瘍的發生， 像抗腫瘤藥物， 如甲氨蝶吟、環磷酸胺、阿黴素等。
抗生素氨于西林、頭抱氨氣甲硝哇及替硝娃等， 可誘發口腔變態反應而產生潰瘍。
柳氮磺吮喂， 目前廣泛用於治療潰瘍性結腸炎、類風濕性關節炎、銀屑病和結節性紅斑等疾病。 它也可引起口腔潰瘍。
抑制胃酸分泌的藥物， 如奧美拉哇、西咪替丁， 在用藥4～5天后， 患者可出現口幹、口腔新膜糜爛等症狀， 其機制可能與其在抑制胃酸分泌的同時影響了唾液腺的分泌有關。
解熱鎮痛藥物， 如阿司匹林、雙氯芬酸鈉， 都有引發口腔潰瘍的報導。 以阿司匹林腸溶片為例， 它是有機弱酸， 物件膜有刺激作用， 而口腔新膜血運豐富， 常規服用阿司匹林可導致黏膜損傷。 若患者口腔部膜對該藥特別敏感， 即使是小劑量， 也可造鹹口腔黏膜潰瘍。 降壓藥卡托普利， 亦可起口腔潰瘍的發生。
此外， 某些減肥藥， 如鹽酸西布曲明（商品名：曲美）是一種治療肥胖症的藥物， 作用於中樞系統， 使人增強飽腹感， 減少進食。 有報導稱， 有患者口服西布曲明7-12天后， 出現口腔疼痛、潰瘍。 其原因可能與藥物抑制食欲， 導致維生素及微量元素缺乏有關。
