水針療法是腦癱治療的重要手段之一, 應用時需注意選擇主穴和配穴。 主穴分三組, 每次穴位注射使用一組穴位, 三組穴位交替使用, 分別為:啞門和腎俞, 風池和足三裡, 大椎和內關, 以起到溫補脾腎、豁痰開竅的作用。 配穴根據患兒病情、年齡和體質, 每次選用3~5穴。 年齡小、體質差者, 配穴宜少;年齡大、體質較強壯者, 配穴可稍增多。
肢體癱瘓者, 配穴以通經活絡、活血化瘀為主, 取手足陽明經、太陽經、少陽經穴為主。 上肢癱配穴:上肢上舉差者取肩井、肩隅、臂鵬、肩貞;肘關節伸展不利取曲池、肘膠、手三裡;拇指內收取合谷、外關。