肛周膿腫的主要病因是感染因素， 患者的症狀也主要是以流膿為主， 需要注意及時進行治療， 否則引起併發症的幾率非常大， 當然， 肛周膿腫的病因並不是單一的， 還有很多種， 下面就肛周膿腫的常見病因總結如下：
第一， 感染性因素：現代醫學認為， 感染是引起本病的主要原因， 多種疾病都可引起感染， 造成肛周膿腫。
① 因肛裂、痔、肛竇炎、肛門周圍皮膚毛囊汗腺炎及肛門周圍皮膚病等感染， 可形成肛門直腸周圍膿腫。
② 還有某些疾病如白血病、糖尿病、結核病、潰瘍性大腸炎、再生障礙性貧血、全身營養不良等，
第二， 醫源性因素：臨床上屬醫源性引起的肛門直腸周圍膿腫也不少見， 主要有：
① 內痔插枯痔釘或注射療法， 因操作不當或藥劑不潔感染形成粘膜下膿腫。
② 直腸周圍注射化學藥物刺激， 引起組織壞死， 造成直腸周圍膿腫。
③ 乙狀結腸鏡檢查， 造成腹膜穿孔感染， 引起直腸後間隙膿腫。
④ 局部麻醉感染， 或油溶液注入後吸收不良， 而形成膿腫。
第三， 手術後因素：臨床上亦可見到肛門直腸手術引起感染， 而形成的直腸周圍膿腫， 以及尿道術後感染、會陰部術後感染、產後會陰破裂縫合後感染、尾骶骨骨髓炎術後感染等引起的膿腫。
第四， 其它因素：如槍、刀傷， 直腸內異物損傷後感染，
需要注意的一點是， 肛周膿腫的病因雖說主要是以感染因素為主， 這一點與其他肛腸疾病的病因是類似的， 但其實， 感染也並非是肛腸疾病的注意好病因， 最關鍵的是保證平時生活的方式良好， 以及飲食結構的平衡。
