尖銳濕疣的治療臨床上以外治為主， 其中物理治療和藥物治療都是常用的方法。 物理治療以鐳射、凍等為主， 而藥物治療多採用具有腐蝕疣體的藥。
5%5-Fu軟膏：即5-氟尿嘧啶軟膏。 是一用的抗腫瘤藥物， 它能抑制細胞的增殖， 力量較為溫和， 一般需治療2～3周。
30%三氯醋酸：是一種強酸， 可用來燒灼疣體， 每週用藥2次， 要注意保護周圍皮膚和粘膜。
疣脫欣：為高效的治療尖銳濕疣的藥物， 刺激性較輕， 外用局部， 每日1次， 3-5天即可。
20%的足葉草酯酊：每週用1～2次。 本藥有副作用， 要注意保護周圍皮膚粘膜， 塗藥2～4小時後洗去。 有致畸作用，
干擾素：局部外用干擾素通過刺激T細胞及對病毒的抑制作用而起到治療效果， 對小的尖銳濕疣有一定效果。 外用的優點是藥物無刺激性， 局部不會出現紅腫、疼痛等不良反應。 缺點是起效較慢， 需連續外用4～6周。
5%咪喹莫特霜：也是一種免疫調節劑。 外用， 與干擾素相似。 優點是藥物無刺激性， 局部不會出現紅腫、疼痛等不良反應。 缺點是起效較慢， 需連續外用6周以上。
複方硝酸溶液：主要成分為硝酸、醋酸、草酸二水合物、乳酸等， 可選擇性腐蝕疣體， 對正常粘一膜刺激小。 一般用藥後1～2天疣體可脫落。
