中醫常根據女性尖銳濕疣患者的體質、疣體特點、全身症狀等將其分為濕熱下注證、外染毒邪證和氣血瘀滯證3型。 由於中藥取材方便， 標本兼治， 目前仍有很多尖銳濕疣患者接受中醫治療。
1、濕熱下注證
治療以宜清利濕熱， 解毒消疣為主。 常用方藥由蒼術、黃柏、生苡仁、土茯苓、丹皮、通草、澤瀉、馬齒莧等藥物組成， 方中蒼術、黃柏清下焦濕熱；生苡仁健脾除濕， 具有抗病毒的功能；配土茯苓、丹皮、通草、澤瀉、馬齒莧解毒除濕， 活血化瘀。 臨床應用時還可隨證加減， 對於濕熱嚴重的患者， 可加入龍膽草， 便秘嚴重者可加入蘆薈等等。
2、外染毒邪證
治療以清熱解毒為主。 常用方藥為去疣三號方， 該方由馬齒莧、敗醬草、紫草、大青葉、木賊草等藥物組成， 方中馬齒莧為君藥， 清熱解毒；輔以敗醬草、紫草、大青葉、木賊草加強清熱解毒、活血散結之效。 臨床應用時還可隨證加減， 對於皮損灰暗， 病程較長的患者， 可加用蜂房、丹參、紅花等活血化瘀之品。
3、血瘀滯證
治療以理氣活血、化瘀散結為主。 常用方藥為桃紅四物湯， 該方由桃仁、紅花、川芎、當歸、白芍、丹參、蜂房、柴胡、夏枯草等藥物組成， 方中桃仁、紅花、川芎、當歸、丹參、蜂房具有活血化瘀的功效；柴胡疏肝理氣， 引藥直達病所；夏枯草清熱解毒， 軟堅散結。 臨床應用時也可隨證加減， 對於氣虛嚴重者可加用生黃芪以補氣解毒，
