女性患有甲亢後， 在病情沒有得到很好的控制前， 一般不建議懷孕， 因為妊娠合併甲亢可以導致先天性胎兒發育異常， 還可能發生早產及娩出低體重兒， 併發妊高症的風險也會大大高於沒有患有甲亢的婦女， 因此應在甲亢治癒後才考慮妊娠。
許多女性在妊娠期感覺疲勞、多汗、多食消瘦、煩躁易怒， 結果經過檢查診斷為甲狀腺功能亢進。 這時候， 只要及時得當的進行治療， 妊娠合併甲亢的婦女一樣可以生出健康的寶寶。 由於婦女在妊娠期服用的藥物會部分通過胎盤而進入胎兒體內， 因此在選擇藥物時應慎重。
妊娠期甲亢患者應選用相對較少通過胎盤的藥物， 妊娠早期即可開始應用抗甲狀腺藥物， 此時胎兒甲狀腺尚未發育成熟， 不具有正常功能， 因此抗甲狀腺藥物對胎兒的甲狀腺影響較小。 孕早期快速控制甲亢症狀， 以利於妊娠中晚期可以將藥物減量。 在選擇藥物時， 甲基硫氧嘧啶由於分子量較大， 較少通過胎盤， 為妊娠期糖尿病的首選藥物。 在妊娠中期， 胎兒的甲狀腺功能基本成熟， 這時候患者抗甲狀腺藥物就需減量至最小有效量。 妊娠中晚期患者的甲狀腺功能不易控制較嚴格， 只需保持較正常人稍高的水準即可。
