中醫理論的兩個重要特點是整體觀念和辨證施治。 這兩個特點也體現在氣功治療中。 精神與形體同練， 以及氣功對形體的作用也不是單純地體現在身體的一個部分、一個內臟、一個系統， 而是對全身各系統組織都有影響， 這些是我們所熟知的氣功對人體的整體作用。 在氣功整體作用的基礎上， 也存在某一功法和某一方式練功對某種病變更適應的情況。 根據患者體質、病情等因素選擇合適的功法或不同練功方式的作法被稱為辯證選功。 其常用的方法有：
1、根據病情選擇不同的練功手段為主的方法：
(1)調息為主的功法：有些病變發生在肺， 引起呼吸系統的功能低下， 例如矽肺、肺結核、哮喘等。 對這些病變， 選擇以吐呐調息為主要鍛煉手段的氣功功法， 例如吐呐功、六字訣等。
(2)調身為主的功法：有些患者病情不重， 但是體質稍差， 筋骨肌肉薄弱。 對此可選擇調身為主的形體功。 這類功法多為動功， 所謂“外練筋骨皮”即指此而言。 此外動功的姿勢不斷變換還可增加趣味性， 尤其對性格活躍、難以靜下來的初學者， 更宜先學動功。
(3)調神為主的功法：調神功也稱為意守功， 具有調整神經興奮性， 緩解心理緊張等重要作用。 由於這類功法更加強調意念的運用， 講求“意氣相隨”， 被稱為“內練一口氣”。 病變不同， 意守的部位也需有所變動。
2、根據體質病情選擇不同體勢功法：
(1)病重體虛者：可選擇臥位靜功
(2)體弱患者：可選擇半臥位、靠坐位、或坐位的靜功。
(3)病輕體壯者：可選擇站樁， 或行走功法。
3、根據氣質性格差別選擇靜、動功法：
(1)對於青年人， 尤其是思想活躍， 注意力不易集中， 難以入靜的人， 可先選擇動功鍛煉， 待注意力能容易地集中到各種動作所要求的意念中後， 再過渡到靜功鍛煉上。
(2)對於思想沉靜、注意力易於集中的人， 可先選擇靜功， 待很快達到入靜狀態後， 再過渡到動功鍛煉上來。
4、根據四時季節所主內臟選擇功法：
春季多練調肝的功法， 夏季多練調心的功法， 夏秋之交多練調脾的功法， 秋季多練調肺的功法， 冬季多練調腎的功法。
5、根據五臟配五行的關係選擇功法：
五禽戲、六字訣等功法的每一節都與一個臟腑相連， 可根據不同臟腑病變選擇相應的節段功法加強鍛煉。
6、根據子午流注理論選擇功法：
子午流注中的每一時辰都與一個臟腑相連， 可根據病變臟腑的主時， 在相應時辰裡加強練功。
辨證練氣功是相對的靈活的， 可依一種方法來選功， 也可依多種方法結合來選功。 要取得良好的效果， 在辨證選擇氣功的基礎上， 更要理解和掌握好練氣功要領。
